在这个操作系统上，Redmi K40 Pro采用的是小米的MIUI 12系统，基于Android 11版本。它的桌面图标是平滑圆角矩形设计，与整个屏幕的圆角相吻合，没有明显割裂感，同时息屏、锁屏还加入了动态效果，壁纸选择丰富；界面显示支持浅色模式、深色模式，晚上可开启深色模式，省电也不刺眼。

另外，操作界面上的标题栏字体有粗细、大小区分，这形成的观感上的反差，让查找目标变得更显眼，操作时更准确快速，有效避免误触等。

小米的智能语音助手小爱同学也在其中，可随时唤醒，语音操作简单又快捷。值得一提的是，该系统加强了手机的隐私保护，它把一些应用的权限交给用户来选择，还能在后台清晰的掌握每个权限的使用频率和情况等，整个操作智能又安全。有一点需要说明的是，该机支持最新的MIUI12.5版本升级，后续有推送后就可以直接更新了。